Avaliação in silico do efeito de pontes salinas em uma quimera Xilanase-XBP
As Xilanases (E.C. 3.2.1.8) são enzimas produzidas por vários tipos de microrganismos, desde fungos a leveduras e bactérias. Essas macromoléculas vem ganhado o foco nos processos industriais biotecnológicos, mais recentemente, na produção de combustíveis a partir da biomassa (etanol de 2ª geração)....
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| Autor principal: | |
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| Outros Autores: | |
| Formato: | bachelorThesis |
| Idioma: | pt_BR |
| Publicado em: |
Universidade Federal do Rio Grande do Norte
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| Assuntos: | |
| Endereço do item: | https://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/38274 |
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| Resumo: | As Xilanases (E.C. 3.2.1.8) são enzimas produzidas por vários tipos de microrganismos, desde fungos a leveduras e bactérias. Essas macromoléculas vem ganhado o foco nos processos industriais biotecnológicos, mais recentemente, na produção de combustíveis a partir da biomassa (etanol de 2ª geração). Neste contexto, um conjunto de enzimas deve ser aplicado durante todo o processo (rota enzimática), e as xilanases compõem o grupo das enzimas utilizadas. As xilanases são chamadas de enzimas acessório, pois hidrolisam a xilana possibilitando o acesso à celulose, que por outras vias enzimáticas, produzirá o etanol. Recentemente, foram produzidas versões quimeras, da enzima xilanase, que obtiveram atividade catalítica melhorada. O processo consistiu em uma estratégia semiracional de fusão de proteínas, através da inserção de uma Xilanase GH11 da bactéria Bacillus subtilis a uma proteína ligadora de xilose (XBP, do inglês, xylose binding protein).
O presente trabalho avaliou o efeitos de pontes salinas encontradas em uma das quimera
geradas. Dessa forma, foram realizadas mutações in silico promovendo a deleção de pontes
salinas presentes na quimera e na xilanase isolada. Os mutantes estudados foram: R344A
e D267A. Com esses mutantes propõe se a deleção de pontes salinas pela substituição
das cadeias laterais dos resíduos de arginina e ácido aspártico por alanina no domínio
xilanase e XBP, respectivamente. As estruturas resultantes foram avaliadas a partir de
análises das simulações de dinâmica molecular (DM). Foi identificado através de análises
conformacionais adotadas pelas enzimas durante o tempo de simulação que as estruturas
se mantêm estáveis e não apresentam desnaturação. Além disso, a mutação que confere a
quebra da ponte salina no domínio da xilanase se mostra mais promissoras para aumentar
sua atividade catalítica devido a novas conformações adotadas pela região do seu dedão,
dessa forma, conferindo a xilanase um aumento do volume da cavidade catalítica. |
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