Marcadores barcode em Spondias do Nordeste: o caso específico de S. bahiensis
Spondias bahiensisP. Carvalho, Van den Berg & M. Machado is one of the five species ofSpondiasgenus present in Brazil, mainly occurring in the Northeast of Brazil. The plant was identified for many years asSpondias spdue to the doubts about the possibility of being a hybrid betweenSpondias tub...
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Formato: | Dissertação |
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Publicado em: |
Universidade Federal do Rio Grande do Norte
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Endereço do item: | https://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/30804 |
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Marcadores molecualres Cajarana Filogenia molecular DNA Molecular markers Molecular phylogeny Buriti, Francisca Janekely Marcadores barcode em Spondias do Nordeste: o caso específico de S. bahiensis |
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Spondias bahiensisP. Carvalho, Van den Berg & M. Machado is one of the five species ofSpondiasgenus present in Brazil, mainly occurring in the Northeast of Brazil. The plant was identified for many years asSpondias spdue to the doubts about the possibility of being a hybrid betweenSpondias tuberosaandSpondias mombin.S. bahiensiswas identified based on molecular biology studies involving barcode markers that confirmed the plant as a new species. The objective of this study is to address the intraspecific variability ofS. bahiensisspecies in relation to the morphological characteristics of the fruit and the fruit flavor and to resolve doubts related to the classification of the specie that could remain exist. We intend to investigate if the genetic variability in the species can be accessed with the available barcode markers. Methodology used consisted in collecting plant material (young leaves) from five species of Spondias, includingS. bahiensis, at different locations in the states of Rio Grande do Norte and Paraíba, and carrying out PCR amplifications with universal barcodes markers rbcL, matK, trnG-trnS, trnH-psbA, rpoB, and rpoC. The intraspecific variabilaidae of S. bahiensis was studied from experimental plantings of EMPARN -Agricultural Research Company of Rio Grande do Norte in the municipality of Ipanguaçu, Rio Grande do Norte. The results obtained allowed the amplification and sequencing of the barcode regions by the different markers used and the realization of phylogenetic trees that confirm, in this analysis, the taxonomic position of S. bahiensis in comparison with the other species of the genus |
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Lucio, Paulo Sergio Marinho |
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ri-123456789-308042020-12-06T08:06:34Z Marcadores barcode em Spondias do Nordeste: o caso específico de S. bahiensis Buriti, Francisca Janekely Lucio, Paulo Sergio Marinho Barbosa, Aulus Estevão Anjos de Deus Blaha, Carlos Alfredo Galindo Marcadores molecualres Cajarana Filogenia molecular DNA Molecular markers Molecular phylogeny Spondias bahiensisP. Carvalho, Van den Berg & M. Machado is one of the five species ofSpondiasgenus present in Brazil, mainly occurring in the Northeast of Brazil. The plant was identified for many years asSpondias spdue to the doubts about the possibility of being a hybrid betweenSpondias tuberosaandSpondias mombin.S. bahiensiswas identified based on molecular biology studies involving barcode markers that confirmed the plant as a new species. The objective of this study is to address the intraspecific variability ofS. bahiensisspecies in relation to the morphological characteristics of the fruit and the fruit flavor and to resolve doubts related to the classification of the specie that could remain exist. We intend to investigate if the genetic variability in the species can be accessed with the available barcode markers. Methodology used consisted in collecting plant material (young leaves) from five species of Spondias, includingS. bahiensis, at different locations in the states of Rio Grande do Norte and Paraíba, and carrying out PCR amplifications with universal barcodes markers rbcL, matK, trnG-trnS, trnH-psbA, rpoB, and rpoC. The intraspecific variabilaidae of S. bahiensis was studied from experimental plantings of EMPARN -Agricultural Research Company of Rio Grande do Norte in the municipality of Ipanguaçu, Rio Grande do Norte. The results obtained allowed the amplification and sequencing of the barcode regions by the different markers used and the realization of phylogenetic trees that confirm, in this analysis, the taxonomic position of S. bahiensis in comparison with the other species of the genus Spondias bahiensis é uma das cinco espécies do gênero Spondias presentes no Brasil, principalmente ocorrendo no Nordeste brasileiro. A planta foi durante muitos anos identificada como Spondias sp em função da dúvida que havia em relação à possibilidade de se tratar de um híbrido entre Spondias tuberosa e Spondias monbim. S. bahiensis foi então assim denominada com base em estudos de biologia molecular envolvendo marcadores barcode que confirmaram tratar-se de uma nova espécie. O objetivo desse estudo é abordar a variabilidade intraespecífica na espécie S. bahiensis com relação à características morfológicas do fruto e do sabor da fruta e dirimir dúvidas quanto à classificação da espécie que por ventura possam existir. Como também, pretende-se averiguar se a variabilidade genética na espécie pode ser acessada com os marcadores barcode disponíveis. A metodologia utilizada consistiu em realizar coletas de material vegetal (folhas jovens) das cinco espécies de Spondias, inclusive de S. bahiensis, em diferentes localidades dos estados do Rio Grande do Norte de e da Paraíba, e a realização de amplificações de PCR com marcadores barcode universais rbcL, matK, trnG-trnS, trnH-psbA, rpoB, e rpoC. A variabilidade intraespecífica de S. bahiensis foi estudada a partir de plantas do plantio experimental da EMPARN - Empresa de Pesquisa Agropecuária do Rio Grande do Norte no município de Ipanguaçu, Rio Grande do Norte. Os resultados obtidos permitiram a amplificação e sequenciamento das regiões barcode pelos diferentes marcadores utilizados e a realização de árvores filogenéticas que confirmam, nesta análise, a posição taxonômica de S. bahiensis em comparação com as demais espécies do gênero 2020-12-01T16:10:05Z 2020-12-01T16:10:05Z 2020-09-04 masterThesis BURITI, Francisca Janekely. Marcadores barcode em Spondias do Nordeste: o caso específico de S. bahiensis. 2020. 38f. Dissertação (Mestrado em Ciências Florestais) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal, 2020. https://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/30804 pt_BR Acesso Aberto application/pdf Universidade Federal do Rio Grande do Norte Brasil UFRN PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM CIÊNCIAS FLORESTAIS |