Genotipagem e proteômica de isolados ambientais de Candida tropicalis obtidos do ambiente costeiro

Candida tropicalis is considered the second most virulent species of the genus Candida. Among the virulence factors related to this species, there is a strong production of biofilm, adhesion to human oral epithelial cells, secretion of lytic enzymes, morphogenesis and phenotipic switching. In add...

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Detalhes bibliográficos
Autor principal: Silva, Diana Lúzia Zuza Alves
Outros Autores: Chaves, Guilherme Maranhão
Formato: doctoralThesis
Idioma:pt_BR
Publicado em: Universidade Federal do Rio Grande do Norte
Assuntos:
Candida tropicalis
Estresse osmótico
Genotipagem
Análise proteômica
Endereço do item:https://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/30411
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Estresse osmótico
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Análise proteômica
Silva, Diana Lúzia Zuza Alves
Genotipagem e proteômica de isolados ambientais de Candida tropicalis obtidos do ambiente costeiro
description Candida tropicalis is considered the second most virulent species of the genus Candida. Among the virulence factors related to this species, there is a strong production of biofilm, adhesion to human oral epithelial cells, secretion of lytic enzymes, morphogenesis and phenotipic switching. In addition, C. tropicalis is osmotolerant and this characteristic is important for its persistence in the coastal environment, causing health risk to the community. The objective of this study was to carry out a bibliographic review on C. tropicalis, focusing on all the subjects mentioned previously. In addition, microsatellite and MALDI-TOF/MS techniques were used to evaluate the genotypic and phenotypic variability of 62 isolates of C. tropicalis obtained from different geographical sites of an urban beach located in the northeast of Brazil, during two different climatic seasons (dry and rainy seasons), besides evaluating the population dynamics of this species in the coastal environment throughout the year. There was a trend for isolates collected in the same period of the year to be placed in the same cluster, by both techniques, however only 27 strains (43.5%) were placed in the same cluster in both the microsatellite and MALDI-TOF/MS, which suggests a relatively low correspondence between these two typing techniques. Furthermore, it was observed that isolates obtained from the same collection timepoint were grouped within the same cluster or in close clusters, and that isolates obtained from the same geographic site are, in most cases, considered identical or highly related to at least one other isolate, by both techniques, suggesting genetic relatdness. The methods employed also demonstrated the heterogeneity of C. tropicalis in the coastal environment. Highly related strains were found in different geographic collection sites, demonstrating that C. tropicalis may be dispersed over long distances. In view of the incipient use of MALDI-TOF/MS, further studies are necessary to consolidate this technique as a yeast typing tool, when compared to the microsatellite technique, which is consolidated as a genotyping method for Candida spp.
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In addition, microsatellite and MALDI-TOF/MS techniques were used to evaluate the genotypic and phenotypic variability of 62 isolates of C. tropicalis obtained from different geographical sites of an urban beach located in the northeast of Brazil, during two different climatic seasons (dry and rainy seasons), besides evaluating the population dynamics of this species in the coastal environment throughout the year. There was a trend for isolates collected in the same period of the year to be placed in the same cluster, by both techniques, however only 27 strains (43.5%) were placed in the same cluster in both the microsatellite and MALDI-TOF/MS, which suggests a relatively low correspondence between these two typing techniques. Furthermore, it was observed that isolates obtained from the same collection timepoint were grouped within the same cluster or in close clusters, and that isolates obtained from the same geographic site are, in most cases, considered identical or highly related to at least one other isolate, by both techniques, suggesting genetic relatdness. The methods employed also demonstrated the heterogeneity of C. tropicalis in the coastal environment. Highly related strains were found in different geographic collection sites, demonstrating that C. tropicalis may be dispersed over long distances. In view of the incipient use of MALDI-TOF/MS, further studies are necessary to consolidate this technique as a yeast typing tool, when compared to the microsatellite technique, which is consolidated as a genotyping method for Candida spp. Candida tropicalis é considerada a segunda espécie mais virulenta do gênero Candida. Dentre os fatores de virulência relacionados à essa espécie, destaca-se forte produção de biofilme, adesão a células epiteliais bucais humanas, secreção de enzimas líticas, morfogênese e phenotipic switching. Além disso, C. tropicalis é osmotolerante e essa característica é importante para sua persistência no ambiente costeiro, acarretando risco sanitário para a comunidade. O objetivo desse trabalho foi realizar uma revisão bibliográfica de C. tropicalis, com foco em todos os assuntos mencionados. Além disso, utilizou-se as técnicas de microssatélite e MALDI-TOF/ MS para avaliar a variabilidade genotípica e fenotípica de 62 isolados de C. tropicalis obtidos de diferentes pontos geográficos de uma praia urbana localizada na região nordeste do Brasil, durante duas estações climáticas diferentes (estações secas e chuvosas), avaliando-se também a dinâmica populacional dessa espécie no ambiente costeiro ao longo do ano. Constatou-se uma tendência de que isolados coletados em um mesmo período do ano fossem agrupados em um mesmo cluster, pelas duas técnicas, porém apenas 27 cepas (43,5%) foram colocadas no mesmo cluster nos dendrogramas do microssatélites e no do MALDI-TOF/MS, o que indica uma correspondência relativamente baixa entre essas duas técnicas de tipagem. Além disso, observou-se que isolados obtidos em uma mesma coleta foram agrupados em um mesmo cluster ou em clusters próximos, e que isolados obtidos do mesmo ponto geográfico são, na maioria dos casos, considerados idênticos ou altamente relacionados a pelo menos outro isolado, pelas duas técnicas, indicando relativo grau de relacionamento. Os métodos empregados também demonstraram a heterogeneidade de C. tropicalis no ambiente costeiro. Cepas altamente relacionadas foram encontradas em diferentes pontos geográficos de coleta, demonstrando que C. tropicalis pode se dispersar por longas distâncias. Tendo em vista o uso incipiente de MALDI-TOF/MS, são necessários mais estudos para consolidar essa técnica como ferramenta de tipagem de leveduras, quando comparada à técnica de microssatélite, que já está bem estabelecida como método de genotipagem de Candida spp. 2020-10-14T16:45:55Z 2020-10-14T16:45:55Z 2020-06-17 doctoralThesis SILVA, Diana Lúzia Zuza Alves. Genotipagem e proteômica de isolados ambientais de Candida tropicalis obtidos do ambiente costeiro. 2020. 134f. Tese (Doutorado em Ciências da Saúde) - Centro de Ciências da Saúde, Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal, 2020. https://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/30411 pt_BR Acesso Aberto application/pdf Universidade Federal do Rio Grande do Norte Brasil UFRN PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM CIÊNCIAS DA SAÚDE

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