Revisão da família GOMPHILLACEAE (ASCOMYCOTA LIQUENIZADO): filogenia, sistemática e evolução
Gomphillaceae is considered one of the most diverse families of foliicolous lichens. The objective of the present research is to review the family Gomphillaceae (Ascomycota lichenized), especially the foliicolous taxa, using morphological and molecular characters. The methodology consisted of usi...
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| Autor principal: | |
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| Outros Autores: | |
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Brasil
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Foliícolas Filogenia Nomenclatura rDNA CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS: SISTEMÁTICA E EVOLUÇÃO |
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Foliícolas Filogenia Nomenclatura rDNA CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS: SISTEMÁTICA E EVOLUÇÃO Leite, Amanda Barreto Xavier Revisão da família GOMPHILLACEAE (ASCOMYCOTA LIQUENIZADO): filogenia, sistemática e evolução |
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Gomphillaceae is considered one of the most diverse families of foliicolous lichens. The
objective of the present research is to review the family Gomphillaceae (Ascomycota
lichenized), especially the foliicolous taxa, using morphological and molecular characters.
The methodology consisted of using samples collected in areas of Atlantic Forest, Brejo de
Altitude and Amazon, in Brazil, in addition to samples collected in other Latin American
countries such as Cuba, Mexico, Panama, Costa Rica and Guatemala. The collected material
was pressed, refrigerated, analyzed and selected according to the presence of representatives
of the family Gomphillaceae. After that, the samples were identified, morphologically
reviewed and molecularly analyzed using the mtSSU rDNA and nuLSU rDNA markers. A
total of 2,127 leaves containing foliicolous lichens was collected and 502 specimens were
selected for identification and molecular analysis. However, 309 specimens were used in the
final phylogenetic analysis for the family, added to 28 sequences from GenBank (including
the outgroup). A total of 464 sequences were obtained for the Gomphillaceae family, 272 new
for nuLSU and 136 new for mtSSU. The results obtained from this work help to explain the
distribution of genera and species belonging to Gomphillaceae, contributing to the systematic
evolutionary knowledge within the group. 13 new genera phylogenetically established for the
family (Adelphomyces Xavier-Leite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov., Aptrootidea XavierLeite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov., Aulaxinella Xavier-Leite, M. Cáceres & Lücking,
gen. nov., Batistomyces Xavier-Leite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov., Bezerroplaca XavierLeite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov., Caleniella Xavier-Leite, M. Cáceres & Lücking, gen.
nov., Monocalenia Xavier-Leite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov., Pseudocalenia XavierLeite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov., Roselviria Xavier-Leite, M. Cáceres & Lücking, gen.
nov., Serusiauxiella Xavier-Leite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov., Sipmanidea XavierLeite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov., Verruciplaca Xavier-Leite, M. Cáceres & Lücking,
gen. nov., and Vezdamyces Xavier-Leite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov..), four newly
reinstated genera (Microxyphiomyces Bat., Valle & Peres, Psathyromyces Bat. & Peres,
Spinomyces Bat. & Peres ex Xavier-Leite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov., and
Sporocybomyces H. Maia), and 53 new combinations are introduced for species included in
the new and re-established genera. In addition, the analyzes confirmed polyphyletic groups,
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ri-123456789-265212024-03-19T04:01:26Z Revisão da família GOMPHILLACEAE (ASCOMYCOTA LIQUENIZADO): filogenia, sistemática e evolução Leite, Amanda Barreto Xavier Goto, Bruno Tomio Cáceres, Marcela Eugênia da Silva Theodoro, Raquel Cordeiro Pereira, Eugênia Cristina Gonçalves Bezerra, José Luiz Forno, Manuela Dal Foliícolas Filogenia Nomenclatura rDNA CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS: SISTEMÁTICA E EVOLUÇÃO Gomphillaceae is considered one of the most diverse families of foliicolous lichens. The objective of the present research is to review the family Gomphillaceae (Ascomycota lichenized), especially the foliicolous taxa, using morphological and molecular characters. The methodology consisted of using samples collected in areas of Atlantic Forest, Brejo de Altitude and Amazon, in Brazil, in addition to samples collected in other Latin American countries such as Cuba, Mexico, Panama, Costa Rica and Guatemala. The collected material was pressed, refrigerated, analyzed and selected according to the presence of representatives of the family Gomphillaceae. After that, the samples were identified, morphologically reviewed and molecularly analyzed using the mtSSU rDNA and nuLSU rDNA markers. A total of 2,127 leaves containing foliicolous lichens was collected and 502 specimens were selected for identification and molecular analysis. However, 309 specimens were used in the final phylogenetic analysis for the family, added to 28 sequences from GenBank (including the outgroup). A total of 464 sequences were obtained for the Gomphillaceae family, 272 new for nuLSU and 136 new for mtSSU. The results obtained from this work help to explain the distribution of genera and species belonging to Gomphillaceae, contributing to the systematic evolutionary knowledge within the group. 13 new genera phylogenetically established for the family (Adelphomyces Xavier-Leite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov., Aptrootidea XavierLeite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov., Aulaxinella Xavier-Leite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov., Batistomyces Xavier-Leite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov., Bezerroplaca XavierLeite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov., Caleniella Xavier-Leite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov., Monocalenia Xavier-Leite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov., Pseudocalenia XavierLeite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov., Roselviria Xavier-Leite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov., Serusiauxiella Xavier-Leite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov., Sipmanidea XavierLeite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov., Verruciplaca Xavier-Leite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov., and Vezdamyces Xavier-Leite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov..), four newly reinstated genera (Microxyphiomyces Bat., Valle & Peres, Psathyromyces Bat. & Peres, Spinomyces Bat. & Peres ex Xavier-Leite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov., and Sporocybomyces H. Maia), and 53 new combinations are introduced for species included in the new and re-established genera. In addition, the analyzes confirmed polyphyletic groups, and the previously distinguished and well supported genera. Finally, some small genera have not yet been molecularly sampled. Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Dentre as famílias de liquens foliícolas, Gomphillaceae é considerada uma das mais diversas. O objetivo do trabalho é revisar a família Gomphillaceae (Ascomycota liquenizados), especialmente as espécies foliícolas, utilizando caracteres morfológicos e moleculares. A metodologia utilizada consistiu de amostras coletadas em áreas de Mata Atlântica, Brejo de Altitude e Amazônia, no Brasil, somadas a amostras coletadas em outros países da América Latina como Cuba, México, Panamá, Costa Rica e Guatemala. O material coletado foi prensado, refrigerado, analisado e selecionado de acordo com a presença de representantes da família Gomphillaceae. Após isso, as amostras foram identificadas, revisadas morfologicamente e analisadas molecularmente utilizando os marcadores mtSSU rDNA e nuLSU rDNA. Foram coletadas 2.127 folhas contendo liquens foliícolas e 502 espécimes foram selecionadas para identificação e análise molecular. Porém, 309 espécimes foram utilizados na análise filogenética final para a família, somadas a 28 do GenBank (incluindo o outgroup). Foi obtido um total de 464 sequências para a família Gomphillaceae, sendo 272 novas para nuLSU e 136 novas para mtSSU. Os resultados obtidos a partir deste trabalho servem para explicar a distribuição de gêneros e espécies pertencentes a Gomphillaceae, contribuindo para o conhecimento sistemático evolutivo já que são descritos 13 novos gêneros estabelecidos filogeneticamente para a família (Adelphomyces Xavier-Leite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov., Aptrootidea Xavier-Leite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov., Aulaxinella Xavier-Leite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov., Batistomyces Xavier-Leite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov., Bezerroplaca Xavier-Leite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov., Caleniella Xavier-Leite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov., Monocalenia Xavier-Leite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov., Pseudocalenia Xavier-Leite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov., Roselviria Xavier-Leite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov., Serusiauxiella Xavier-Leite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov., Sipmanidea Xavier-Leite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov., Verruciplaca Xavier-Leite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov., and Vezdamyces Xavier-Leite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov..), quatro gêneros restabelecidos (Microxyphiomyces Bat., Valle & Peres, Psathyromyces Bat. & Peres, Spinomyces Bat. & Peres ex Xavier-Leite, M. Cáceres & Lücking, gen. nov., and Sporocybomyces H. Maia), e 53 novas combinações são introduzidas para as espécies incluídas nos gêneros novos e restabelecidos. Além disso, as análises confirmaram grupos polifiléticos, gêneros previamente distintos e bem suportados. Além disso, alguns pequenos gêneros ainda não foram amostrados molecularmente. 2020-11-23 2019-01-16T19:15:05Z 2018-08-31 doctoralThesis LEITE, Amanda Barreto Xavier. Revisão da família GOMPHILLACEAE (ASCOMYCOTA LIQUENIZADO): filogenia, sistemática e evolução. 2018. 253f. Tese (Doutorado em Sistemática e Evolução) - Centro de Biociências, Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal, 2018. https://repositorio.ufrn.br/jspui/handle/123456789/26521 por Acesso Aberto application/pdf Brasil UFRN PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM SISTEMÁTICA E EVOLUÇÃO |