Descobrindo redes de associação envolvendo miRNAs e lincRNAs humanos através de uma análise de eQTL

Variations in the level of gene expression are among the main causes of phenotypic diversity in organisms, including the development of pathologies and response to drugs in humans. Non-coding RNAs (ncRNAs) play an important role in the complex mechanism of regulatory networks. Although not yet fu...

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Detalhes bibliográficos
Autor principal: Lins, Paulo Roberto Branco
Outros Autores: Barrera, Júnior
Formato: Dissertação
Idioma:por
Publicado em: Brasil
Assuntos:
Expressão gênica
miRNA
lincRNA
Redes de associação
Polimorfismo
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS: BIOINFORMÁTICA
Endereço do item:https://repositorio.ufrn.br/jspui/handle/123456789/25868
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spelling ri-123456789-258682019-01-30T05:09:43Z Descobrindo redes de associação envolvendo miRNAs e lincRNAs humanos através de uma análise de eQTL Lins, Paulo Roberto Branco Barrera, Júnior Souza, Sandro José de Figuerola, Wilfredo Blanco Kurtz, Guilherme Suarez Expressão gênica miRNA lincRNA Redes de associação Polimorfismo CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS: BIOINFORMÁTICA Variations in the level of gene expression are among the main causes of phenotypic diversity in organisms, including the development of pathologies and response to drugs in humans. Non-coding RNAs (ncRNAs) play an important role in the complex mechanism of regulatory networks. Although not yet fully understood, two representatives of the ncRNAs emerge in recent researches as protagonists in the development of clinical conditions. They are the microRNAs (miRNAs) and the long intergenic non-coding RNAs (lincRNAs). Thus, the present work integrated public data to catalog the vast landscape of the regulatory effects of miRNAs and lincRNAs in the human genome. Through expression Quantitative Trait Loci (eQTL) analysis, variations that had a putative effect on gene expression were identified. Association networks were also created relating the eQTL analysis results to traits of clinical and/or pharmacological relevance. Through this, associations that may continue to arouse the interest of new studies involving the theme were revealed. Mental and coronary disorders, in addition to cancer, were the most evidenced traits in the study results. Variações no nível de expressão gênica estão entre as principais causas da diversidade fenotípica nos organismos, incluindo o desenvolvimento de patologias e a resposta aos fármacos em humanos. Os RNAs não codificantes (ncRNAs) desempenham um papel importante no complexo mecanismo das redes regulatórias. Embora ainda não completamente compreendidos, dois representantes dos ncRNAs despontam em pesquisas recentes como protagonistas no desenvolvimento de quadros clínicos. São eles os microRNAs (miRNAs) e os RNAs não codificantes intergênicos longos (lincRNAs). Assim, o presente trabalho integrou dados públicos para catalogar o vasto panorama dos efeitos regulatórios dos miRNAs e dos lincRNAs no genoma humano. Através de uma análise de expression Quantitative Trait Loci (eQTL) foram identificadas variações que tivessem efeito putativo na expressão gênica. Redes de associação também foram criadas relacionando os resultados da análise eQTL com tratos de relevância clínica e/ou farmacológica. Por meio dessa, foram reveladas associações que podem continuar despertando o interesse de novos estudos envolvendo o tema. Distúrbios mentais e coronários, além do câncer, foram os tratos com maior evidência nos resultados do estudo. 2018-09-17T21:11:45Z 2018-09-17T21:11:45Z 2018-07-19 masterThesis LINS, Paulo Roberto Branco. Descobrindo redes de associação envolvendo miRNAs e lincRNAs humanos através de uma análise de eQTL. 2018. 55f. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Instituto Metrópole Digital, Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal, 2018. https://repositorio.ufrn.br/jspui/handle/123456789/25868 por Acesso Aberto application/pdf Brasil UFRN PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOINFORMÁTICA
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Lins, Paulo Roberto Branco
Descobrindo redes de associação envolvendo miRNAs e lincRNAs humanos através de uma análise de eQTL
description Variations in the level of gene expression are among the main causes of phenotypic diversity in organisms, including the development of pathologies and response to drugs in humans. Non-coding RNAs (ncRNAs) play an important role in the complex mechanism of regulatory networks. Although not yet fully understood, two representatives of the ncRNAs emerge in recent researches as protagonists in the development of clinical conditions. They are the microRNAs (miRNAs) and the long intergenic non-coding RNAs (lincRNAs). Thus, the present work integrated public data to catalog the vast landscape of the regulatory effects of miRNAs and lincRNAs in the human genome. Through expression Quantitative Trait Loci (eQTL) analysis, variations that had a putative effect on gene expression were identified. Association networks were also created relating the eQTL analysis results to traits of clinical and/or pharmacological relevance. Through this, associations that may continue to arouse the interest of new studies involving the theme were revealed. Mental and coronary disorders, in addition to cancer, were the most evidenced traits in the study results.
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